Russian Journal of GeneticsRussian Journal of GeneticsГенетика0016-67583034-5103The Russian Academy of Sciences66718810.31857/S0016675824100114wekcgyКРАТКИЕ СООБЩЕНИЯКРАТКИЕ СООБЩЕНИЯShort CommunicationTransferability of SSR Markers Developed on Gosseberry to Red and Black CurrantsТестирование микросателлитных локусов крыжовника на черной и красной смородинеPikunovaA. V.ПикуноваА. В.
Russian Federation
pikuanna84@mail.ruPavlenkoA. A.ПавленкоА. А.
Russian Federation
pikuanna84@mail.ruDolzhikovaM. A.ДолжиковаМ. А.
Russian Federation
pikuanna84@mail.ruGolyaevaO. D.ГоляеваО. Д.
Russian Federation
pikuanna84@mail.ruKnyazevS. D.КнязевС. Д.
Russian Federation
pikuanna84@mail.ruAll-Russian Research Institute of Fruit Crop Breeding, VNIISPKВсероссийский научно-исследовательский институт селекции плодовых культур16102024601011712126022025Copyright ©; 2024, Russian Academy of SciencesCopyright ©; 2024, Российская академия наук2024Russian Academy of SciencesРоссийская академия наукhttps://transsyst.ru/0016-6758/article/view/667188

Eleven microsatellite markers previously developed based on gooseberry sequences were tested on red and black currants. As a result, all microsatellite loci were amplified on representatives of black currant, but on representatives of red currant there was no amplification in three loci (RucANS, RucDFR2-1, RucDFR1-3). Polymorphic loci have been identified for both black and red currants. In the MTT-7 locus in the studied black currant genotypes, amplification of 3 fragments has been observed. Probably this locus is duplicated in black currant genome. At the same time, in red currant, amplification typical for monolocus microsatellite has been observed in the MTT-7 locus. The RucHLH-1 and RucUFGT loci were tested on a hybrid red currant family (Belaya Potapenko × 1426-21-80). By genetic mapping, the localization of the RucHLH-1 locus was established on linkage group 4 in the red currant genome, and the localization of RucUFGT was presumably on linkage group 1. The set of microsatellite loci for the currant genus is currently limited. This work shows that some of the SSR markers developed on gooseberries are amplified and reveal polymorphism in currants and can be used to study both black and red currants.

Одиннадцать микросателлитных маркеров, ранее разработанных на основании сиквенсов крыжовника, были протестированы на красной и черной смородине. В результате все микросателлитные локусы амплифицировали на представителях смородины черной, а на представителях смородины красной в трех локусах не было амплификации (RucANS, RucDFR2-1, RucDFR1-3). Выявлены полиморфные локусы как для черной, так и для красной смородины. В локусе MTT-7 у исследуемых генотипов черной смородины наблюдается амплификация трех фрагментов, возможно, данный локус дублицирован. При этом на красной смородине в локусе MTT-7 наблюдается амплификация, типичная для монолокусного микросателлита. Локусы RucHLH-1 и RucUFGT были протестированы на гибридной семье смородины красной (Белая Потапенко × 1426-21-80). Путем генетического картирования установлена локализация локуса RucHLH-1 на группе сцепления 4 в геноме красной смородины и локализация RucUFGT (предположительно) на группе сцепления 1. Набор микросателлитных локусов для рода Смородина на данный момент ограничен. В данной работе показано, что часть SSR-маркеров, разработанных на крыжовнике, амплифицируются и выявляют полиморфизм и на смородине тоже, а также могут быть использованы для исследований как черной, так и красной смородины.

currantsgoosseberrymicrosatellite lociDNA-markersSSRRibes L.genetic polymorphismlinkage mappingсмородинакрыжовникмикросателлитные локусыДНК-маркерыSSRRibes L.генетический полиморфизмгенетическое картированиеРоссийский научный фонд (гранд)Russian Science Foundation (grand)23-26-00160Vieira M.L., Santini L., Diniz A.L., Munhoz C.D. Microsatellite markers: What they mean and why they are so useful // Genet. Mol. Biol. 2016. V. 4. № 39. P. 312–328. https://doi.org/10.1590/1678-4685-GMB-2016-0027Brennan R., Jorgensen L., Woodhead M., Russell J. Development and characterization of SSR markers in Ribes species // Mol. Ecol. 2002. V. 2. № 3. P. 327–330. https://doi.org/10.1046/j.1471-8286.2002.00233.хBrennan R., Jorgensen L., Hackett C. et al. The development of a genetic linkage map of blackcurrant (Ribes nigrum L.) and the identification of regions associated with key fruit quality and agronomic traits // Euphytica. 2008. V. 161. P. 19–34. https://doi.org/10.1007/s10681-007-9412-8Пикунова А.В, Горюнова С.В, Горюнов Д.В. Генетическая карта смородины красной (Ribes rubrum L.), построенная с применением SSR и SNP ДНК-маркеров // Генетика. 2020. V. 56. № 11. С. 1340–1344. https://doi.org/10.31857/S0016675820100100Kalia R.K., Rai M.K., Kalia S. et al. Microsatellite markers: An overview of the recent progress in plants // Euphytica. 2011. V. 177. № 3. P. 309–334. https://doi.org/10.1007/s10681-010-0286-9Князев С.Д., Огольцова Т.П. Селекция смородины черной на современном этапе. Орел: Изд-во ОрелГАУ, 2004. 238 с.Janczewski E. Monograph of the currants Ribes L. // Mem. Soc. Phys. Hist. Nat. Geneve. 1907. V. 35. P. 199–517.Berger A. A taxonomic review of currants and gooseberries // N.Y. Agric. Exptl Sta. Techn. Bull. 1924. V. 109. P. 1–118.Doyle J.J., Doyle J.L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue // Phytochem. Bull. 1987. V. 19. P. 11–15.Antonius K., Karhu S., Kaldm H. et al. Development of the Northern European Ribes core collection based on a microsatellite (SSR) marker diversity analysis // Plant Genet. Res.: Characterization and Utilization. 2012. V. 10. P. 70–73. https://doi.org/10.1017/S1479262111000980Vidyagina E.O., Lebedev V.G., Subbotina N.M. The development of the genic SSR markers for analysis of genetic diversity in gooseberry cultivars // Agronomy. 2021. V. 11. № 6. https://doi.org/10.3390/agronomy11061050Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research — an update // Bioinformatics. 2012. V. 28. Р. 2537–2539. https: 10.1111/j.1471- 8286.2005.01155.xПикунова А.В., Мартиросян Е.В., Князев С.Д., Рыжова Н.Н. Применение RAPD-анализа для изучения генетического полиморфизма и филогенетических связей у представителей рода Ribes L // Экол. генетика. 2011. Т. 9. № 2. С. 34–44.Pikunova A., Goryunova S., Goryunov D. Genetic diversity and pedigree analysis of red currant germplasm // Plants. 2022. V. 11. № 13. https://doi.org/10.3390/plants11131623