Russian Journal of GeneticsRussian Journal of GeneticsГенетика0016-67583034-5103The Russian Academy of Sciences66691210.31857/S001667582301006XCMMVBJГЕНЕТИКА ЖИВОТНЫХGenetic Diversity Research in the Population of the Kyrgyz Mountain Merino Using Microsatellite LociИсследование генетического разнообразия в популяции кыргызского горного мериноса с использованием микросателлитных локусовIsakovaZh. T.ИсаковаЖ. Т.jainagul@mail.ruBekturovA. В.БектуровА. Б.jainagul@mail.ruChortonbaebT. D.ЧортонбаевТ. Д.jainagul@mail.ruKipenV. N.КипеньВ. Н.jainagul@mail.ruMukeevaS. B.МукееваС. Б.jainagul@mail.ruShergazievU. A.ШергазиевУ. А.jainagul@mail.ruAitbaevK. A.АйтбаевК. А.jainagul@mail.ruInstitute of Molecular Biology and MedicineНаучно-исследовательский институт молекулярной биологии и медициныSkryabin Kyrgyz National Agrarian UniversityКыргызский национальный аграрный университет им. К.И. СкрябинаInstitute of Genetics and Cytology of the National Academy of Sciences of BelarusИнститут генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси01012023591899626022025Copyright ©; 2023, Ж.Т. Исакова, А.Б. Бектуров, Т.Д. Чортонбаев, В.Н. Кипень, С.Б. Мукеева, У.А. Шергазиев, К.А. АйтбаевCopyright ©; 2023, Ж.Т. Исакова, А.Б. Бектуров, Т.Д. Чортонбаев, В.Н. Кипень, С.Б. Мукеева, У.А. Шергазиев, К.А. Айтбаев2023Ж.Т. Исакова, А.Б. Бектуров, Т.Д. Чортонбаев, В.Н. Кипень, С.Б. Мукеева, У.А. Шергазиев, К.А. АйтбаевЖ.Т. Исакова, А.Б. Бектуров, Т.Д. Чортонбаев, В.Н. Кипень, С.Б. Мукеева, У.А. Шергазиев, К.А. Айтбаевhttps://transsyst.ru/0016-6758/article/view/666912

The aim was to ascertain genetic structure and diversity of Kyrgyz mountainous merino via microsatellite DNA markers. We analyzed DNA samples of 109 Kyrgyz mountaneous merino specimens, bred in three state breeding factories (STB), including “Orgochor” in the Issykul Province, “Katta-Taldyk” in the Osh Province and STB named after Luschikhin in the Talas Province. We identified 126 alleles in 12 microsatellite loci (McM042, INRA006, McM527, ETH152, CSRD247, OarFCB20, INRA172, INRA063, MAF065, MAF214, INRA005, INRA023). There were 6 to 16 alleles in each locus (mean 10.500 ± 0.957 alleles per locus). We identified 67 rare alleles (prevalence less than 5.0%), which made 53.2% of all alleles found. The greatest number of alleles were found in INRA023 (12 alleles), INRA005 (13 alleles), OarFCB20 and INRA063 (14 in each) and CSRD247 (16 alleles) autosomal loci. Based on the mean number per locus (Na = = 10.500 ± 0.957), number of efficient alleles (Ne = 4.556 ± 0.394), the observed (Ho = 0.731 ± 0.023) an expected (He = 0.761 ± 0.021) heterozygosity, we conclude high genetic diversity of the selected sheep sample attributed to Kyrgyz mountainous merino and its significant genetic potential.

Проведена оценка генетической структуры и генетического разнообразия кыргызского горного мериноса с использованием микросателлитных локусов ДНК. В исследование включены 109 овец данной породы, разводимых в трех государственных племенных заводах (ГПЗ): ГПЗ “Оргочор” (Иссык-Кульская обл.), ГПЗ “Катта-Талдык” (Ошская обл.) и ГПЗ им. М.Н. Лущихина (Таласская обл.). В 12-ти исследованных локусах (McM042, INRA006, McM527, ETH152, CSRD247, OarFCB20, INRA172, INRA063, MAF065, MAF214, INRA005, INRA023) было идентифицировано 126 аллелей. Число аллелей в каждом локусе варьировало от 6 до 16, при среднем значении 10.500 ± 0.957 аллелей на локус. Определены 67 редких аллелей (с частотой встречаемости менее 5.0%), что составляет 53.2% от общего количества выявленных аллелей. Наибольшее число аллелей наблюдалось в аутосомных локусах: INRA023 (12 аллелей), INRA005 (13 аллелей), OarFCB20 и INRA063 (по 14 аллелей), CSRD247 (16 аллелей). Результаты оценки популяционных параметров, включая эффективное число аллелей (Ne = 4.556 ± 0.394), уровень наблюдаемой (Ho = 0.731 ± 0.023) и ожидаемой (He = = 0.761 ± 0.021) гетерозиготности позволяют сделать заключение о высоких значениях генетического разнообразия исследуемой выборки овец породы кыргызский горный меринос и ее значительном генетическом потенциале.

Kyrgyz mountain merinoDNAmicrosatellite markersgenotyping.кыргызский горный мериносДНКмикросателлитные локусыгенотипирование.Об итогах единовременного пересчета скота и домашней птицы в Кыргызской Республике. http://www.stat.kg/ru/news/ob-itogah-edinovremennogo-perescheta-skota-i-domashnej-pticy-v-kyrgyzskoj-respublike/Лущихина Е.М., Чебодаев Д.В. Кыргызский горный меринос // НАН КР-Б., 2014. 204 с.Исакова Ж.Т., Исаев М.А., Кипень В.Н и др. Оценка генетического разнообразия кыргызской породы лошадей с использованием микросателлитных маркеров – расширенное геногеографическое исследование // Генетика. 2021. Т. 57. № 4. С. 420–428. https://doi.org/10.31857/S0016675821040032Денискова Т.Е., Доцев А.В., Охлопков И.М. и др. Характеристика генетической структуры снежного барана (Ovis nivicola lydekkeri) Верхоянской горной страны // Генетика. 2018. Т. 54. № 3. С. 342–348. https://doi.org/10.7868/S0016675818030074Kharzinova V.R., Zinovieva N.A. Pattern of genetic diversity in local and commercial pig breeds based on microsatellite analysis // Vavilov J. Genet. and Breeding. 2020. V. 24(7). P. 747–754. https://doi.org/10.18699/VJ20.669Lemesh V.A., Ageets V.Yu., Nosonova A.Yu. et al. Genetic structure of the carp (Cyprinus carpio carpio) population grown in aquaculture in the Republic of Belarus // Rep. Natl Acad. Sci. of Belarus. 2021. V. 65. № 1. P. 68–75. https://doi.org/10.29235/1561-8323-2021-65-1-68-75Носова А.Ю., Кипень В.Н., Царь А.И., Лемеш В.А. Дифференциация гибридного потомства белого (Hypophthalmichthys molitrix val.) и пестрого (H. nobilis rich.) толстолобиков на основании полиморфизма микросателлитных локусов // Генетика. 2020. Т. 56. № 3. С. 313–320. https://doi.org/10.31857/S0016675820030121Исакова Ж.Т., Тонкосунов Б.И., Кипень В.Н. и др. Филогенетический анализ для кыргызской породы лошадей по 17 микросателлитным маркерам // Генетика. 2019. Т. 55. № 1. С. 94–99. https://doi.org/10.1134/S0016675819010077Sambrook J., Russell D.W. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001. 2344 p.Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research – an update // Bioinformatics. 2012. V. 28(19). P. 2537–2539. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts460Excoffier L., Smouse P.E., Quattro J.M. Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes: Application to human mitochondrial DNA restriction data // Genetics. 1992. V. 131(2). P. 479–491. https://doi.org/10.1093/genetics/131.2.479Polymorphic information content & Heterozygosity [Электронный ресурс]. Режим доступа: https://www.gene-calc.pl/pic. Дата доступа: 10.02.2021.Botstein D., White R.L., Skalnick M.H., Davies R.W. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphism // Am. J. Hum. Genet. 1980. V. 32. P. 314–331.Dossybayev K., Orazymbetova Z., Mussayeva A. et al. Genetic diversity of different breeds of Kazakh sheep using microsatellite analysis // Arch. Anim. Breed. 2019. V. 62(1). P. 305–312. https://doi.org/10.5194/aab-62-305-2019Денискова Т.Е., Селионова М.И., Гладырь Е.А. и др. Изменчивость микросателлитов в породах овец, разводимых в России // С.-хоз. биология. 2016. Т. 51. № 6. С. 801–810. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2016.6.801rusAhmed Z., Babar M.E., Hussain T. et al. Genetic diversity analysis of Kail Sheep by using microsatellite markers // J. Anim. Plant Sci. 2014. V. 24(5). P 1329–1333.Szumiec A., Radko A., Koseniuk A. et al. Application of 11 STR markers for the evaluation of genetic variation in sheep. The global standard for livestock date // ICAR Technical Series. 2018. V. 23. P. 141–145.Столповский Ю.А., Захаров-Гезехус И.А. Проблема сохранения генофондов доместицированных животных // Вавиловский журн. генет. селекции. 2017. Т. 21. № 4. С. 477–486. https://doi.org/10.18699/VJ17.266